MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stanieria cyanosphaera PCC 7437 plasmid pSTA7437.03

Total Repeats: 1149

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019750	AAAG	2	8	144	151	75 %	0 %	25 %	0 %	434401191
2	NC_019750	AAAT	2	8	163	170	75 %	25 %	0 %	0 %	434401191
3	NC_019750	GAGTT	2	10	205	214	20 %	40 %	40 %	0 %	434401191
4	NC_019750	A	6	6	244	249	100 %	0 %	0 %	0 %	434401191
5	NC_019750	TAA	2	6	251	256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434401191
6	NC_019750	GTG	2	6	289	294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434401191
7	NC_019750	ATAG	2	8	354	361	50 %	25 %	25 %	0 %	434401191
8	NC_019750	ATA	2	6	373	378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434401191
9	NC_019750	AGT	2	6	380	385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434401191
10	NC_019750	ATT	2	6	387	392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434401191
11	NC_019750	TGA	2	6	409	414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434401191
12	NC_019750	A	6	6	449	454	100 %	0 %	0 %	0 %	434401191
13	NC_019750	AATAGA	2	12	464	475	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	434401191
14	NC_019750	TAA	2	6	476	481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434401191
15	NC_019750	A	7	7	480	486	100 %	0 %	0 %	0 %	434401191
16	NC_019750	GAA	2	6	510	515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434401191
17	NC_019750	TAA	2	6	549	554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434401191
18	NC_019750	ATA	2	6	555	560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434401192
19	NC_019750	GTT	2	6	568	573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434401192
20	NC_019750	A	6	6	597	602	100 %	0 %	0 %	0 %	434401192
21	NC_019750	T	9	9	629	637	0 %	100 %	0 %	0 %	434401192
22	NC_019750	TTG	4	12	825	836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434401193
23	NC_019750	TTTTG	2	10	841	850	0 %	80 %	20 %	0 %	434401193
24	NC_019750	TGTC	2	8	854	861	0 %	50 %	25 %	25 %	434401193
25	NC_019750	TCG	2	6	868	873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434401193
26	NC_019750	T	6	6	878	883	0 %	100 %	0 %	0 %	434401193
27	NC_019750	CTG	3	9	926	934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434401193
28	NC_019750	CTG	2	6	938	943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434401193
29	NC_019750	GTTG	2	8	991	998	0 %	50 %	50 %	0 %	434401193
30	NC_019750	TCTT	2	8	1027	1034	0 %	75 %	0 %	25 %	434401193
31	NC_019750	CTG	2	6	1051	1056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434401193
32	NC_019750	CGT	2	6	1108	1113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434401193
33	NC_019750	TCT	2	6	1114	1119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434401193
34	NC_019750	GCT	2	6	1138	1143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434401193
35	NC_019750	TGG	2	6	1160	1165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434401193
36	NC_019750	CTG	2	6	1175	1180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434401193
37	NC_019750	TCC	2	6	1185	1190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434401193
38	NC_019750	TTCT	2	8	1212	1219	0 %	75 %	0 %	25 %	434401193
39	NC_019750	GGT	3	9	1222	1230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434401193
40	NC_019750	CGGTCG	2	12	1263	1274	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	434401193
41	NC_019750	GTT	2	6	1281	1286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434401193
42	NC_019750	GCT	2	6	1301	1306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434401193
43	NC_019750	CCT	2	6	1309	1314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434401193
44	NC_019750	TGC	2	6	1356	1361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434401193
45	NC_019750	TGG	2	6	1372	1377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434401193
46	NC_019750	G	6	6	1440	1445	0 %	0 %	100 %	0 %	434401194
47	NC_019750	CTC	2	6	1452	1457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434401194
48	NC_019750	CTT	2	6	1489	1494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434401194
49	NC_019750	TGC	2	6	1533	1538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434401194
50	NC_019750	T	6	6	1568	1573	0 %	100 %	0 %	0 %	434401194
51	NC_019750	CTG	2	6	1602	1607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434401194
52	NC_019750	ATT	2	6	1666	1671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434401194
53	NC_019750	AAATTA	2	12	1775	1786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434401195
54	NC_019750	CTT	2	6	1836	1841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434401195
55	NC_019750	ATGG	2	8	1877	1884	25 %	25 %	50 %	0 %	434401195
56	NC_019750	CAG	2	6	1964	1969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434401195
57	NC_019750	ATTAA	2	10	2033	2042	60 %	40 %	0 %	0 %	434401195
58	NC_019750	AGC	3	9	2107	2115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434401195
59	NC_019750	TAA	2	6	2117	2122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434401195
60	NC_019750	AGA	2	6	2295	2300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434401196
61	NC_019750	ACCGAA	2	12	2323	2334	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	434401196
62	NC_019750	A	6	6	2362	2367	100 %	0 %	0 %	0 %	434401196
63	NC_019750	A	6	6	2381	2386	100 %	0 %	0 %	0 %	434401196
64	NC_019750	AAATCA	2	12	2465	2476	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	434401196
65	NC_019750	GAA	2	6	2500	2505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434401196
66	NC_019750	T	6	6	2520	2525	0 %	100 %	0 %	0 %	434401196
67	NC_019750	CGA	2	6	2562	2567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434401196
68	NC_019750	ACT	2	6	2573	2578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434401196
69	NC_019750	ACCA	2	8	2591	2598	50 %	0 %	0 %	50 %	434401196
70	NC_019750	AACC	2	8	2765	2772	50 %	0 %	0 %	50 %	434401197
71	NC_019750	AT	3	6	2825	2830	50 %	50 %	0 %	0 %	434401197
72	NC_019750	AGA	2	6	2897	2902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434401197
73	NC_019750	GAT	2	6	2936	2941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434401197
74	NC_019750	CT	3	6	2967	2972	0 %	50 %	0 %	50 %	434401197
75	NC_019750	TGA	2	6	3048	3053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434401197
76	NC_019750	CCT	2	6	3243	3248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434401198
77	NC_019750	TTGA	2	8	3287	3294	25 %	50 %	25 %	0 %	434401198
78	NC_019750	AT	3	6	3319	3324	50 %	50 %	0 %	0 %	434401198
79	NC_019750	AGAT	2	8	3345	3352	50 %	25 %	25 %	0 %	434401198
80	NC_019750	AGC	2	6	3373	3378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434401198
81	NC_019750	AAG	2	6	4157	4162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434401199
82	NC_019750	GAC	2	6	4325	4330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434401199
83	NC_019750	ATTT	2	8	4332	4339	25 %	75 %	0 %	0 %	434401199
84	NC_019750	AGA	2	6	4358	4363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434401199
85	NC_019750	AGA	2	6	4367	4372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434401199
86	NC_019750	AAAG	2	8	4377	4384	75 %	0 %	25 %	0 %	434401199
87	NC_019750	AGA	2	6	4405	4410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434401199
88	NC_019750	CAG	2	6	4441	4446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434401199
89	NC_019750	AAT	2	6	4450	4455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434401199
90	NC_019750	A	6	6	4477	4482	100 %	0 %	0 %	0 %	434401199
91	NC_019750	ATG	2	6	4558	4563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434401200
92	NC_019750	TTA	2	6	4597	4602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434401200
93	NC_019750	TGC	2	6	4640	4645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434401200
94	NC_019750	AGGT	2	8	4648	4655	25 %	25 %	50 %	0 %	434401200
95	NC_019750	AAAC	2	8	4692	4699	75 %	0 %	0 %	25 %	434401200
96	NC_019750	TGC	4	12	4727	4738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434401200
97	NC_019750	TGAGGT	2	12	4745	4756	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	434401200
98	NC_019750	A	7	7	4838	4844	100 %	0 %	0 %	0 %	434401200
99	NC_019750	TTA	3	9	5543	5551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434401201
100	NC_019750	AGA	2	6	5558	5563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434401201
101	NC_019750	A	6	6	5593	5598	100 %	0 %	0 %	0 %	434401201
102	NC_019750	CGAG	2	8	5735	5742	25 %	0 %	50 %	25 %	434401201
103	NC_019750	TAG	2	6	5809	5814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434401201
104	NC_019750	TTC	2	6	5899	5904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434401201
105	NC_019750	TCA	2	6	5950	5955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434401201
106	NC_019750	ATT	2	6	5976	5981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434401201
107	NC_019750	TGG	2	6	6031	6036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434401201
108	NC_019750	ATT	2	6	6056	6061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434401201
109	NC_019750	T	6	6	6098	6103	0 %	100 %	0 %	0 %	434401201
110	NC_019750	TCT	2	6	6210	6215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434401201
111	NC_019750	AGA	3	9	6224	6232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434401201
112	NC_019750	AAGA	2	8	6258	6265	75 %	0 %	25 %	0 %	434401201
113	NC_019750	A	7	7	6269	6275	100 %	0 %	0 %	0 %	434401201
114	NC_019750	CAAA	2	8	6284	6291	75 %	0 %	0 %	25 %	434401201
115	NC_019750	ATG	2	6	6316	6321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434401201
116	NC_019750	ACAG	2	8	6328	6335	50 %	0 %	25 %	25 %	434401201
117	NC_019750	ACA	2	6	6420	6425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434401201
118	NC_019750	ACA	2	6	6428	6433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434401201
119	NC_019750	GAA	2	6	6562	6567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434401201
120	NC_019750	A	7	7	6633	6639	100 %	0 %	0 %	0 %	434401201
121	NC_019750	GCAA	2	8	6650	6657	50 %	0 %	25 %	25 %	434401201
122	NC_019750	GGTTT	2	10	6684	6693	0 %	60 %	40 %	0 %	434401201
123	NC_019750	TGC	2	6	6718	6723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434401201
124	NC_019750	CTA	3	9	6796	6804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434401201
125	NC_019750	TGG	2	6	6809	6814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434401201
126	NC_019750	AGG	2	6	6853	6858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434401201
127	NC_019750	A	7	7	6861	6867	100 %	0 %	0 %	0 %	434401201
128	NC_019750	GGA	2	6	6996	7001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434401201
129	NC_019750	GAA	2	6	7077	7082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434401201
130	NC_019750	AAG	2	6	7125	7130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434401201
131	NC_019750	TACGCC	2	12	7305	7316	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	434401201
132	NC_019750	TCC	2	6	7388	7393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434401201
133	NC_019750	AGT	2	6	7415	7420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434401201
134	NC_019750	CAG	3	9	7569	7577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434401201
135	NC_019750	ATTC	2	8	7580	7587	25 %	50 %	0 %	25 %	434401201
136	NC_019750	CCA	2	6	7615	7620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434401201
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142	NC_019750	ATCT	2	8	7933	7940	25 %	50 %	0 %	25 %	434401201
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262	NC_019750	TCT	2	6	15998	16003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434401208
263	NC_019750	AAG	2	6	16024	16029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434401208
264	NC_019750	GCT	2	6	16068	16073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434401208
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266	NC_019750	CT	3	6	16132	16137	0 %	50 %	0 %	50 %	434401208
267	NC_019750	GAA	2	6	16185	16190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434401208
268	NC_019750	CTA	2	6	16209	16214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434401208
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271	NC_019750	A	6	6	16324	16329	100 %	0 %	0 %	0 %	434401208
272	NC_019750	AAT	2	6	16377	16382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434401208
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373	NC_019750	GA	4	8	21445	21452	50 %	0 %	50 %	0 %	434401215
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375	NC_019750	GAAA	2	8	21709	21716	75 %	0 %	25 %	0 %	434401216
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379	NC_019750	G	8	8	22040	22047	0 %	0 %	100 %	0 %	434401216
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381	NC_019750	ATT	2	6	22133	22138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434401216
382	NC_019750	CCT	2	6	22199	22204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434401216
383	NC_019750	TGA	2	6	22210	22215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434401216
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386	NC_019750	GAAGA	2	10	22262	22271	60 %	0 %	40 %	0 %	434401216
387	NC_019750	TATT	2	8	22333	22340	25 %	75 %	0 %	0 %	434401216
388	NC_019750	C	7	7	22386	22392	0 %	0 %	0 %	100 %	434401216
389	NC_019750	TC	3	6	22403	22408	0 %	50 %	0 %	50 %	434401216
390	NC_019750	ACC	2	6	22455	22460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434401216
391	NC_019750	CCT	2	6	22471	22476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434401216
392	NC_019750	CTA	2	6	22513	22518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434401216
393	NC_019750	ATCT	2	8	22524	22531	25 %	50 %	0 %	25 %	434401216
394	NC_019750	ACC	2	6	22582	22587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434401216
395	NC_019750	AACCA	2	10	22592	22601	60 %	0 %	0 %	40 %	434401216
396	NC_019750	AAAG	2	8	22619	22626	75 %	0 %	25 %	0 %	434401216
397	NC_019750	TAAAGC	2	12	22635	22646	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434401216
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399	NC_019750	GATC	2	8	22714	22721	25 %	25 %	25 %	25 %	434401216
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402	NC_019750	AAT	2	6	22891	22896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434401216
403	NC_019750	ATCT	2	8	22953	22960	25 %	50 %	0 %	25 %	434401216
404	NC_019750	A	6	6	23054	23059	100 %	0 %	0 %	0 %	434401216
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424	NC_019750	AACG	2	8	24034	24041	50 %	0 %	25 %	25 %	434401217
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426	NC_019750	CAGCTA	2	12	24067	24078	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	434401217
427	NC_019750	CCCAA	2	10	24116	24125	40 %	0 %	0 %	60 %	434401217
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